El centro dispone de 4 aulas para Educación Infantil, 6 para Eduación Primaria y 4 para Educación Secundaria Obligatoria. Los alumnos del centro tienen ademas a su disposición un laboratorio, aulas de música, informática, tecnología, idiomas, biblioteca, salón de actos y gimnasio.
Los alumnos del Colegio La Magdalena tienen además la posibilidad de realizar actividades extraescolares, tales como tenis, fútbol, natación, danza, aeróbic, funky, judo y piano, con las mejores instalaciones.
Entre las instalaciones deportivas destacan un campo de hierba artificial, un pabellón polideportivo cubierto, un pabellon polideportivo descubierto con dos pistas de tenis y una de baloncesto, asi como una piscina semiolimpica de 25 m, vestuarios y amplias zonas de expansión.